まず Trac.ini の [trac] templates_dir を設定。
[trac]
templates_dir = D:\TracLight/python/share/trac/templates
TracLightning インストール直後は %TRAC_LIGHT_HOME%\python\share\trac\templates に conf フォルダしかないので templates フォルダを追加。
%TRAC_LIGHT_HOME%\python\Lib\site-packages\ 以下あたりを検索してカスタマイズしたい *.html を引っ張ってくる。